Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A3Q8NEV1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms