Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC50Q8IVM0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms