Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms