Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TUBA3EQ6PEY2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms