Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NANOGP8Q6NSW7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms