Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD4Q5VX71 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD4Q5VX71 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms