Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms