Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC12

ATPAF1, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPAF1Q5TC12 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATPAF1Q5TC12 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms