Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C10orf55Q5SWW7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms