Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRMS1LQ5PSV4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms