Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCID2Q5JVF3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms