Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCAF6Q58WW2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCAF6Q58WW2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms