Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC93Q567U6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC93Q567U6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms