Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM259Q4ZIN3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms