Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms