Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms