Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms