Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSPP1Q1MSJ5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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