Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms