Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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