Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA3Q16281 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms