Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PMCHL1Q16048 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms