Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP10Q15642 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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