Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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TRADDQ15628 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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TRADDQ15628 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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TRADDQ15628 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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