Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GAPVD1Q14C86 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GAPVD1Q14C86 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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