Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COL9A3Q14050 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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