Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EXOSC2Q13868 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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