Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RUNX3Q13761 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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