Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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