Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MTMR3Q13615 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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