Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NEUROD1Q13562 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
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