Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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