Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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