Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
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