Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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