Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms