Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD47Q08722 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD47Q08722 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD47Q08722 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD47Q08722 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD47Q08722 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD47Q08722 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD47Q08722 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD47Q08722 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD47Q08722 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms