Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms