Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABPB1Q06547 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms