Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPN11Q06124 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN11Q06124 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms