Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms