Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ACVR1Q04771 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACVR1Q04771 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms