Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CFHR1Q03591 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms