Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms