Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDR2Q01850 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms