Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DEFA6Q01524 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
DEFA6Q01524 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms