Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2F1Q01094 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms