Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX6P78412 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX6P78412 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX6P78412 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX6P78412 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX6P78412 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX6P78412 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX6P78412 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX6P78412 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX6P78412 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX6P78412 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX6P78412 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX6P78412 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX6P78412 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX6P78412 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX6P78412 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX6P78412 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms