Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms