Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD2P62316 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms